Музей истории запорожского казачества находится на острове Хортица в Запорожье и входит в состав Национального заповедника «Хортица».
В экспозиции музея представлены следующие разделы: «Запорожский край в древнейшие времена», «Запорожье в период Киевской Pycи», «Запорожье в казацкие времена», «Заселение Запорожского края в конце XVIII—XX вв». Действуют четыре диорамы: «Битва киевского князя Святослава», «Военный совет на Сечи», «Строительство Днепрогэса им. Ленина» (доступ прекращён в 2006 г.), «Освобождение г. Запорожье 14 октября 1943».
Приём посетителей временно приостановлен в виду начавшихся 2 июня 2015 г. работ по комплексной реэкспозиции.
К наиболее ценным собраниям музейных фондов относятся:
В 60-х годах XX в., во время хрущёвской «оттепели», в украинском обществе распространяются идеи возрождения национальных традиций. В первую очередь это проявляется в намерении увековечения памяти о запорожском казачестве. В это время возникает проект создания историко-культурного заповедника и Музея истории запорожского казачества на острове Хортица.
Над тематической структурой Музея работали выдающиеся ученые, такие как исследователь запорожского казачества Елена Апанович, член-корр. АН УССР и др. В редакции 1966 года тематика экспозиции полностью освещала историю запорожского казачества от его формирования до ликвидации, показывала влияние казачества на дальнейшую судьбу украинского народа.
Содействовали открытию музея М. П. Киценко, П. Т. Тронько при поддержке общественных организаций, в частности, писателей М. Рыльского, П. Тычины, Олеся Гончара и др.
Однако к началу 70-х годов идея создания Музея истории запорожского казачества на Хортице была признана не соответствующим политике Правительства СССР и КПСС. Инициаторы создания музея казачества были обвинены в попустительстве «националистическим иллюзиям и пережиткам» и устранены с занимаемых должностей.
Вместо Музея истории запорожского казачества 14 октября 1983 на Хортице был открыт Музей истории Запорожья, экспозиция которого показывала историю края от древнейших времен до современности. При этом истории запорожского казачества был посвящён один раздел экспозиции. Значительная часть экспозиции была посвящена революционной борьбе и социалистическому строительству в городе Запорожье.
Авторами проекта музейного помещения является группа архитекторов под руководством М. А. Жарикова и В. Г. Стефанчука. Над оформлением экспозиции музея работали украинский советский художник-монументалист, заслуженный деятель искусств УССР А. В. Гайдамака и украинский художник-оформитель, лауреат премии Ленинского комсомола, И. Г. Скорупский.
На волне Перестройки национальное возрождение и усиление интереса к изучению запорожской тематики в 1980-х гг. обусловило перепрофилирование музея в Музей истории запорожского казачества (1988). Вследствие этого, из его экспозиции была изъята значительная часть материалов советского времени. Освобожденные площади используются для проведения различных выставок, посвящённых казацкой тематике. Со 2 июня 2015 г. музей прекратил приём посетителей в виду начавшегося процесса комплексной реэкспозиции.
